Soma
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案例 · 文献研究

把系统综述的资料准备,做成一条能复查的流水线

检索式、去重、纳入排除、证据表——四件事都留下输入与理由。审阅者不必先相信你的结论,他可以直接沿着同一条路径再跑一遍。

Literature study研究模式
4用到的连接器
6执行步骤
.science归档格式
第一步 · 研究问题

先把宽问题收成一个可检索的问句

边界写在前面,后面每一步都引用同一份定义。

问题定义

人群、暴露、结局与时间窗

检索式从这四个字段长出来,而不是从印象里长出来。

检索边界

数据库、语言与研究类型一次写清

边界在执行前定好,中途不放宽,也不在事后解释。

纳入排除

排除理由逐条记录

排除理由不允许留空,它是流程图与敏感性检查的输入。

第二步 · 数据来源

四个连接器,各管一段

取数前逐个授权,检索条件与返回结果一起进入证据链。

数据源在这个案例里做什么取回什么
PubMed已发表文献的题录与摘要检索检索式命中的记录、元数据与摘要
bioRxiv预印本补检,减少漏掉未正式发表结果的概率预印本记录与版本信息
文献图谱顺着主题与引用关系补充检索主题簇与引用关系
研究资源对照立项与数据记录,确认没有高度重叠的研究研究项目与关联记录

本页展示的是路径与产物形态,不展示任何一项具体研究的结论。Soma 的取数一律先经授权,检索条件与返回结果都记入证据链。

第三步 · 执行路径

六步走完资料准备

每一步都有明确的输入与产物,不需要靠记忆补全。

  1. 01
    写下检索式关键词、本体词与时间窗写进研究说明。检索式是这份研究的第一个产物,不是随手一敲。
  2. 02
    授权并检索逐个授权 PubMed 与 bioRxiv。查询条件与返回结果一起进入证据链,事后可以逐字复核。
  3. 03
    去重与初筛按标识符与标题去重;先按标题和摘要做第一轮排除,每条都写下理由。
  4. 04
    全文复核留下的记录回到全文,按预设的纳入标准逐条判断。标准在执行前写死,不在执行中放宽。
  5. 05
    证据表研究设计、样本、结局与结论抽到一张表里,每个字段都指向它的来源记录。
  6. 06
    交付与归档检索式、筛选记录、证据表与图表作为成果一并归档,版本可回滚,整份研究可交给合作者。
第四步 · 产出与证据

交付的是一组文件,而不是一句结论

结论可以有争议,路径必须站得住。

Soma — 证据链本地运行
证据链面板:从结论回到那一次取数
检索式

可复制的检索式

每个连接器的查询条件都被保留,换一个人也能重跑。

证据表

字段指向来源

表里每个字段都能回到它来自的记录,不靠记忆补全。

归档

打包交给合作者

完成的研究可导出为 .science 包:对话分支、文件版本、Notebook 记录与验证证据随包带走。

复查者从哪里入手

复查不需要把研究重做一遍,只需要确认每一步的输入站得住。

  • 从结论点回证据,再从证据点回那一次取数与来源记录。
  • 翻筛选记录,看排除理由是否一致、有没有漏记。
  • 用同一份检索式在连接器里重跑,比较命中结果的变化。
  • 打开版本历史,确认证据表在哪一步被改过、改了什么。

从一个可检索的问句开始

想在自己的课题上走一遍?